Счетная палата России потребовала от крупнейших акционеров Банка Москвы — ВТБ и Андрея Бородина — провести ревизию кредитного портфеля, а также предписала временно отстранить руководство банка, «причастное к сомнительному кредитованию». Проверяющие также остались недовольны отвлечением средств банка на финансирование непрофильных организаций.
По словам аудитора Счетной палаты Михаила Бесхмельницына, в Банке Москвы было выявлено три главные проблемы: организация кредитования, проблемная задолженность и проблема по конверсионным операциям. По его словам, на время проверки должны быть отстранены от должности все лица, которые были причастны к выдаче кредитов, в том числе и сам президент Банка Москвы.
Проверка Банка Москвы началась 13 декабря 2010 года. Аудиту подверглась вся деятельность банка. Проверялись сделки с правительством Москвы и столичными предприятиями и организациями.